LAMMPS是一款精典的分子动力学软件，免费开源，可以模拟液态、固态或气态的粒子的系综。也可以采用不同的力场和边界条件来模拟全原子，聚合物，生物，固态（金属、陶瓷，氧化物），粒状和粗料化体系。LAMMPS可以估算的体系小至几个粒子，大到上百万甚至是上亿个粒子。同时lammps代码可以更改和扩充，可以便捷的为之扩充上新特点和功能来匹配课题的个性化需求。
LAMMPS分子动力学模拟技术与应用LAMMPS基础入门
1LAMMPS的基础入门——初识LAMMPS是哪些？能干哪些？如何用？
1.1LAMMPS在win10和ubuntu系统的安装及使用
1.2in文件结构格式
1.3in文件基本句型：结合实例，讲解in文件常用命令
1.4data文件格式
1.5LAMMPS常见错误解决途径
实例操作：实例操作：运行并理解跟自己科研方向相仿的反例。
LAMMPS进阶（石墨烯、金属材料模拟专题）
2LAMMPS进阶实例操作，理解模拟对象的数学意义——从简单事例迈向文献模型，举一反三提升学习效率
实例操作：实例操作：
2.1把剪切模型转换成拉伸模型
2.2lattice命令石墨烯、金属、合金、高熵合金不同形状模型
2.3石墨烯(不同力场)、金属、合金、高熵合金等拉伸剪切热学性质模拟
LAMMPS进阶（纳米流体模拟专题）
3LAMMPS进阶实例操作，理解模拟对象的数学意义——从简单事例迈向文献模型，举一反三提升学习效率
实例操作：实例操作：
3.1把二维couette和poiseuille流动扩充成三维模型
3.2构建三维管线内的poiseuille流动
3.3进行石墨烯通道内的Couette流动和Poiseuille流动模拟
3.4调节通道表面电荷性质、亲疏水性质，剖析其对流动性质的影响
3.5学习使用packmol，构建复杂混和碱液体系模型
3.6模拟KCl等盐碱液的纳米流体流动
LAMMPS进阶（热传导模拟专题）
4LAMMPS进阶实例操作，理解模拟对象的数学意义——从简单反例迈向文献模型，举一反三提升学习效率
实例操作：
4.1理解导热系数意义
4.2把握lammps估算导热系数的几种方式
4.3碳纳米管等导热系数的模拟估算
LAMMPS进阶（多成份体系模拟专题）
5LAMMPS进阶实例操作，理解模拟对象的数学意义——从简单反例迈向文献模型，举一反三提升学习效率
实实例操作：
5.1金属、合金、高熵合金的磨擦模拟
5.2材料铣削模拟
5.3夹层结构(graphene/C60/graphene)在不同粗糙度条件下的磨擦模拟
LAMMPS进阶（金属、半导体材料的辐照模拟）
6离子辐照对石墨烯、金属、碳化硅的离位损伤模拟
6.1构建模拟体系的初始模型
6.2PKA动能、位移随时间变化
6.3点缺陷结构可视化6.4点缺陷的数目随时间变化
6.5点缺陷的空间分布及演变过程
备选内容，依据课堂进度和学员情况
VMD、OVITO、msi2lmp等有机小分子建模，模型合并及模拟轨迹文件处理等
LAMMPS中级（自建分子力场参数文件和金属有机框架材料晶体模型）
7LAMMPS分子力场文件创建及MOFs材料建模
7.1介绍固体材料单晶硅包试验数据结构，把握基本的材料几何特点
7.2借助MS软件重构MOFs材料单晶硅包模型和H2和CO2分子模型
7.3讲解分子作用势能函数，学习编撰MS软件中的力场参数文件（off文件）
7.4简单介绍巨正则系综MonteCarlo方式
7.5借助Sorption模块将H2和CO2分子插入到MOFs材料
7.6编撰LAMMPS力场文件（frc文件），并通过lammps程序生成data文件
7.7运行能量最小化及体系的预松驰
7.8模拟步骤：包括能量最小化NVT平衡，对研究目标的性质进局长时间轨
迹平衡-输出研究所关心的性质。
实例操作：金属有机框架（实例操作：金属有机框架（MOFs）储氢和碳捕集模拟，估算密度分布，
分子的MSD
LAMMPS中级（分子筛纳米膜分离H2/CO2混和二氧化碳模拟）
8研究H2/CO2在ZIF--77膜材料中分离性能——模拟文献Science346(6215),1356--1359的分离过程
8.1借助MS软件重构ZIF-7膜材料单晶硅包
8.2设计H2/CO2与ZIF-7体系模型
8.3自定义分子力场文件（frc文件），通过
lammps程序生成data文件
8.4运行能量最小化及体系的预松驰
8.5模拟步骤：包括能量最小化NVT平衡，对
研究目标的性质进局长时间轨迹平衡-输出研究所关心的性质。
实例操作：VMD中查看可视化的动态轨迹，估算密度分布，分子的MSD等，抽
取轨迹的动能、势能、总能量等相关数据，对轨迹进行初步剖析。
#6:7:9:8:9:b:3:4:a:7:f:8:7:8:9:e:a:c:c:e:1:1:9:4:3:e:1:4:2:0:3:3#
LAMMPS中级（ReaxFF碳溴化合物的燃烧）
9借助ReaxFF模块研究碳溴化合物的燃烧
9.1ReaxFF反应力场概述
9.2碳溴化合物和二氧化碳分子体系的建立
9.3能量最小化及常温弛豫
9.4升温模拟
9.5低温下氧化过程的模拟
9.6轨迹剖析及产物物种剖析与可视化
实例操作：碳溴化合物燃烧
LAMMPS中级（ReaxFF物理机械抛光）
10借助ReaxFF模块研究物理机械抛光
10.1借助LAMMPS进行复杂体系的建模
10.2能量最小化及预弛豫
10.3施压过程模拟10.4拉伸过程模拟
10.5采用OVITO查看动态轨迹以及数据剖析等
实例操作：物理机械抛光施压过程模拟
以上内容可作为学习参考
