阴、阳两个字是代名词，阴阳代表着事物相互对立又相互联系的两个方面，凡是活动的，上升的，明显的，进行性的，机能亢进的，都属于阳；沉静的、下降的、隐晦的、退行性的、机能减退的、都属于阴。
（一）用阴阳说明人体的组织结构
从人体的组织结构来说，人体的上部属于阳，下部属于阴，体表属于阳，内脏属于阴，背部属于阳，腹部属于阴。每一内脏，又有阴阳之分，如心有心阴，心阳，肾有肾阴，肾阳。这正如黄帝内经素问所说，人生有形，不离阴阳。这是阴阳学说在中医学中的具体应用之一，用阴阳说明人体的组织结构。
（二）用阴阳说明人体的生理功能和病理变化
从人体的生理病理来说，正常的生理活动，是阴阳双方保持协调的结果，正如素问说，阴平阳秘，精神乃治。如果阴阳失调，疾病也就发生。中医临床上见到的阴胜则寒，阳胜则热。阳虚则寒，阴虚则热等现象。即是阴阳失调所致。还有阴阳的任何一方虚弱到一定程度，非可导致另外一方的不足，即临床上常见的阴损及阳，阳损及阴，最后出现阴阳两虚。这是阴阳学说在中医学中的具体应用之二，用阴阳说明人体的生理功能和病理变化。
